清初六家，四王吴恽，并享盛名，前五人皆以山水为擅，惟恽氏以花鸟称绝当代。人们在评论恽寿平的绘画艺术时，往往注重的是他的没骨写生花卉画。其实，他最初是学画山水的。恽寿平早年向伯父恽向（明末山水画家）学画山水，师法元代王蒙、黄公望、倪瓒及明代沈周、文徵明、唐寅等人，并上溯董源、巨然。直到他去世之前，所画山水画作品约占其所有画作的三分之一。他的山水画是在广泛师法古代画家的基础上，造化为师，出古入新，并以清新洒脱、超逸高妙和不染纤尘的艺术特色，形成了自己独特的风格。
恽寿平的山水画造诣很高，颇受后世画家的赞誉。而在针对恽寿平中年后为什么放弃山水画方面的成就而转向以画花卉为主的这个问题上，历来有很多说法。最突出的也是被画史著作引用最多的是，恽寿平与王石谷交好，因见王山水独步，难与争锋，才转而专攻花鸟。画史逸闻不必拘泥真假，若恽寿平真是因为王石谷而专攻花鸟，其原因也当是礼让多于忌惮。因为从恽氏的传世画迹来看，他在山水上的造诣并不逊色于花鸟，与王石谷甚至四王中的任何一人相比，都足以分庭抗礼。尤其是他后期的山水画，颇具倪瓒神韵，一丘一壑，清秀超逸，气味隽雅，实胜过王石谷，只是石谷出名在先。明末清初的画坛上，山水画名家迭出，花鸟画的力量则相对薄弱。恽寿平也是看到了这一点，并且由于经济方面的原因，则选择了“没骨花”技法作为突破，开始主攻花鸟画。而就恽寿平的个人喜好和兴趣来说，他对山水画还是非常偏爱的。
恽寿平悲欢离合的少年经历，对其成年后的绘画成就起着重要的作用。他的性格不像石涛、八大两位朱氏后裔寄画于恨，而是淡泊其志，雅逸其画。恽寿平的山水，于荒率中见秀润，用笔清灵飘逸，气息俊秀潇洒，与当时主盟画坛老成持重的四王风尚相比，別有一段裊娜风流的韵味。他30岁时的作品，尖毫勾皴，浓墨点树、高旷清淡；中期山水，浸润宋元诸家，吸取王蒙等人的长处；40岁左右的作品最为精彩。
1673年作，古松翠峤图
1674年作，古松叠嶂图
1675年作，山水
1677年作，乔林叠嶂图
1683年作，山水
1688年作，万壑秋声图
长汀烟蒙
翠岫春云
对山赏雪图
仿古山水
风声出谷图
古木秋风
湖庄清夏
林柯云汉图
晴川揽胜图
秋林叠翠
秋声图
秋树山居图
秋雨烟峦
山居图
山水
山水
山水
山水
山水人物
石壁图
水村渔乐
水竹幽亭
松溪雅趣
万壑秋声图
万卷书楼
溪山旷远
烟翠人家
烟岚积翠
云山烟雨图
竹路流泉
竹窝图
山水
山水
山水手卷
恽寿平、马元驭合作，富春山居图，手卷
载鹤图，手卷
春山暖翠
荷香水榭
乔柯急涧
秋山图
山水小景
风林晚鸦
千树红霞
山水
山水
六君子图册
仿古山水册
仿古山水册
秋林图册
书画合册
古岸杨柳
水村图
雪山图
云巗观瀑图
南田草衣扇册
