三焦的主要生理功能有二：
一、气行。《难经·六十六难》说“三焦者，原气之别使也，主通行三气，经历于五脏六腑”。滑寿注释说“三焦主持诸气，为原气别使者，以原气赖其导引，潜行默运于一身之中，无或间断也”。由此可知，三焦是人体元气(原气)升降出入的道路，对人体来说至关重要。元气通过三焦方可到达五脏六腑和全身各处。
二、水行。气行则水行，三焦主通行原气，能通调水道，输布水液。故《素问·灵兰秘典论》曰“三焦者，决渎之官，水道出焉”。可见，三焦亦是水液运行的通道，水液的正常代谢依赖于其气化功能的正常。
《难经·三十一难》载：“上焦……其治在膻中；中焦……其治在脐旁；下焦……其治在脐下一寸……三焦，其府在气街。”其中，脐旁指天枢穴，脐下一寸指阴交穴，气街即气冲穴。由此可知，上、中、下三焦的病症分别有其对应的主治穴位，膻中主治上焦疾病，天枢主治中焦疾病，阴交主治下焦疾病，气冲通治三焦疾病。
1.『膻中穴』（但音）
位置：膻中穴位于胸正中线上，两乳连线中点。
功能：宽胸理气、活血止痛、降逆利膈。
上焦症状表现：恶寒、身热不扬、面色淡黄、头重如裹。
膻中穴为任脉穴，是心包经之募穴，八会穴之气会，足太阴、少阴、手太阳、少阳、任脉之交会穴。膻中穴为“气之海”，任脉之气在此吸暖胀散，故又称“上气海穴”。此穴位主治上焦心肺疾病，如呼吸短气、咳逆哮喘、肺痈唾脓等呼吸系统疾病；胸闷、胸痛等心血管疾病；呃逆、不下食等膈肌不利之病症。
2.『天枢穴』
位置：天枢穴位于脐中旁开2寸。
功能：健脾胃、通肠腑、调经带。
中焦症状表现：周身沉重、脘痞不饥、恶心呕吐、大便溏滞、口干不欲饮。
天枢穴为足阳明胃经穴，手阳明大肠经之募穴，在上下腹分界处，斡旋上下，是中焦气机升降的枢纽。以治疗肠胃疾病和妇科疾病为主。主治脾胃肝胆疾病：腹胀、腹痛、肠鸣、泄泻、食不化、不嗜食、奔豚气上冲等消化系统疾病；月事不调、漏下赤白、女子胞中痛等妇科疾病
3.『阴交穴』
位置：在下腹部，前正中线上，当脐中下1寸。
功能：调理经带、利水消肿、温补下焦。
下焦症状表现：小便不畅、大便不通。
阴交穴为任脉穴，在脐下一寸，正为肾间原气所居之处，刺之能调补下焦原气，通利小便。《难经》“下焦者，治在脐下一寸。”阴交为任脉穴、冲脉、足少阴肾经三经交会穴。阴交穴配背俞有补益元气之功效，可调理下焦。主治下焦疾病：月经不调、带下、绝子、产后恶露不止、乳余疾等妇科疾病；水肿癃闭等泌尿系统疾病；阴痒阴汗、疝气、阴中痛等前阴病症；以及命门火衰之腰膝酸软等症。
4.『气冲穴』
位置：大腿内侧，靠近阴茎，在腹股沟稍上方，当脐中下5寸，距前正中线2寸。
功能：尿频尿急、小便不通，睾丸肿痛，小腹胀痛，月经不调，不孕，阳萎，功能性子宫出血。
气冲穴既是胃之气街，又是奇经八脉之冲脉的起始处。《难经》二十七难有云：“冲脉者，起于气冲，并足阳明之经，夹脐上行，至胸中而散也”。冲脉自上而下经历上中下三焦，是五脏六腑十二经脉之海，五脏六腑都禀受其气血的滋养。
气冲穴是冲脉的起始处，主三焦，功能调理三焦、理气调经、调理冲任。主治逆气上攻心、心痛不得息等上焦病症;消化系统腹胀、腹痛、胃肠中热等症；生殖系统阴痒、阴痛、疝气、月经不调、不孕、难产等症；泌尿系统水肿等中下焦病症。
上中下三焦不通引起的病症
上焦不通：就会造成经络淤堵，气血凝滞，出现上火，高血压、高血脂、风湿骨病、颈椎病等。
中焦不通：就会造成腰肌劳损、腰部酸痛、椎间盘突出、女性产后风、老寒腰及老胃肠、便秘等症状。
下焦不通：肝肾功能受阻，就会造成肾虚、女性气虚血亏引起更年期综合症以及妇科炎症等各种妇科杂症。
平淡而神奇的三仁汤：杏仁，正滑石，白通草，白蔻仁，竹叶，厚朴，生薏苡仁，半夏。乃通三焦之良方。
三仁汤的思路，是从上中下三焦，把水湿往外宣，往外降。
三焦，为六腑之一，是上、中、下三焦的合称。上、中、下三焦的病症分别有其对应的主治穴位，膻中主治上焦疾病，天枢主治中焦疾病，阴交主治下焦疾病，气冲通治三焦疾病。
三焦，为六腑之一，是上、中、下三焦的合称。上、中、下三焦将人体划分为三个部位，横膈以上内脏器官为上焦，包括心、肺；横膈以下至脐内脏器官为中焦，包括脾、胃、肝、胆等内脏；脐以下内脏器官为下焦，包括肾、大肠、小肠、膀胱。
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