清廷对西藏的统御由来已久，皇太极时就遣使致书西藏的可汗和大喇嘛，顺治帝对西藏问题的处理，就是对其父祖策略的成功延续。早在1642年，厄鲁特蒙古和和硕特部领袖顾实汗，在五世达赖喇嘛的邀请下，率军入藏，推翻的统治卫藏20多年的噶玛噶举教派的藏巴汗政权，成为西藏及青海地区的最高权力者。
这个地域空前寥廓的国家里，多民族聚居共存，处理好与边疆各民族的关系，成为了入关后顺治帝稳定政权的新挑战，在扶持顾实汗的同时，顺治帝还大力扶持达赖喇嘛，顺治九年，五世达赖洛桑加措率领班禅及顾实汗的代表一行三千人赴京，经历了长途跋涉，终于在年底抵达北京，经过反复斟酌，顺治帝采用了一种特殊的方式迎接五世达赖一行，相聚那天，顺治帝以田猎为名，与达赖相会于南苑猎场。
公元1722年，69岁的康熙帝因病去世，这位南征北战，也为治理社稷江山而奔劳一生的皇帝，为清朝开启了大治的时代，也基本奠定了一个统一国家的雏形。这一年，45岁的雍正皇帝登基，他在位13年，然而刚刚即为的雍正皇帝却面临着西藏分裂的挑战，就在清军驱逐策旺阿拉布坦的过程中，和硕特亲王罗卜藏丹精以及青海和硕特各部首领曾随清军入藏，出了不少力，清廷为表彰他们的功劳，分别给予赏赐，并重新进行了人事安排，但早就想独霸青海、西藏之地的罗卜藏丹津对清廷的安排大为不满。
罗卜藏丹津于雍正元年发动的反清武装叛乱，正式宣布要恢复先人的霸业，即据占西藏，遥控青海，刚刚登上皇帝宝座不久的雍正帝希望罗卜藏丹津能罢兵和睦，但罗卜藏丹津根本不听劝告，清廷的反应迅速而强烈，雍正二年二月，雍正帝任命年庚尧为抚远大将军，从西宁急行军，夜袭罗卜藏丹津，还在酣睡当中的罗卜藏丹津慌乱中换上女人的衣服，投奔准噶尔汗国，仅用十五天的时间，清军便把面积六十万平方公里的土地纳入到管辖之下，解决了青藏地区的问题后，雍正帝又把视线转向准噶尔部。
雍正五年，策旺阿拉布坦去世，其子噶尔丹策凌继立，雍正七年，清廷决定两路进军西北，以解决准噶尔部的威胁，一直到雍正十一年冬，元气大伤的噶尔丹策凌向清廷求和，雍正帝决定议和，希望准噶尔和喀尔喀两部的游牧界限明确划分，永息兵戈，准噶尔汗国的存在，客观上使得清朝西部疆域保持了完整。
公元1735年，雍正帝去世，其子弘历继位，年号乾隆。公元1751年，乾隆皇帝开始了他的第一次南巡，这是一次历时100多天的长途旅行，此次旅行，乾隆拜谒了明太祖陵，还登了泰山，乾隆帝放眼天下，可谓国泰民安，他心静安逸，他发出谕旨，提倡百姓开垦荒地，以增加粮食产量。60年后，全国土地大约增加四五千万亩，人口增加过亿。
25岁登基，在位60年的乾隆帝，回顾他的平生，认为做了两件大事，一件是用兵新疆，一件是六次南巡。公元1745年，乾隆执政第十年，久与清廷为敌，雍正帝一直没有剿灭的噶尔丹策凌病逝，达瓦齐成为准噶尔部首领，1754年，策妄阿拉布坦的外孙阿穆尔萨纳被达瓦齐击败后，率兵投降了清朝，十一月，乾隆帝从北京乘马，疾驰三日，冒着严寒赶到避暑山庄，接见阿穆尔萨纳一行。
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