C#可以被编译成本地二进制代码么？
可以，只有mono支持。先用mcs或者csc编译成assembly, 再mono --aot 你的assembly, 就可以的。
但是这样的话，默认还是需要原始assembly里面的meta data, 你需要再处理一下你的assembly, 让它变成空壳(也就是只有函数的声明，而没有IL代码，怎么处理，自己想办法:) ), 这样的话。你的IL可以完全被隐藏。不过缺点是，这样生成的native code只能在mono环境下运行。
  
在FreeBSD/Linux下，你可以直接做aot(ahead-of-time,相对just-in-time), 但是在windows下，你需要动点脑筋了。需要cygwin和gcc才可以的。因为mono在aot的时候，是需要将IL转化为汇编，进一步由gcc里面的汇编器来产生binary code的。为什么只能用gcc里面的汇编器，因为mono产生的汇编代码是at&t格式的，而VS里面的汇编器只认Intel格式的。